При создании профиля выпуска сертификатов MS CA список доступных шаблонов для выпуска может быть пустой, при этом сам СА доступен и работает.
Проблема может возникнуть в очень редких случаях, при определенных настройках инфраструктуры, когда серверная часть продукта установлена на той же рабочей станции, что и подчиненный центр сертификации, при выключенном корневом центре и при наличии леса доменов.
В свойствах подчиненного центра сертификации, на вкладке безопасности, надо для группы локальных администраторов станции разрешить право "Запросить сертификаты".