При работающем антивирусе Kaspersky Endpoint Security (KES) наблюдается медленная работа с зашифрованными дисками:
При отключенном KES работа с файлами и папками происходит в нормальном режиме.
Причина в некорректной работе KES с зашифрованными данными.
Запросить в службе технической поддержки "Лаборатории Касперского" патч для KES. При обращении указать версию KES и суть проблемы — медленная работа с зашифрованными дисками.