При входе по RDP на удалённую рабочую станцию (сервер), где уже запущен в консольной сессии Единый Клиент, в нём не отображается токен, подключенный физически к клиенту, и проброшенный на сервер по RDP. При этом, в настройках RDP-сессии на клиенте, где запускалась программа mstsc.exe, в поле "Выберите устройства и ресурсы, которые вы хотите использовать во время удалённого сеанса" выбраны смарт-карты.
Перезапустите Единый Клиент на сервере из RDP-сессии.